Michela Natilli ricopre il ruolo di Research Manager presso il Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR) e fa parte del comitato di gestione (management team) di SoBigData, l'infrastruttura di ricerca europea dedicata al Social Mining e alla scienza dei dati, finanziata dall'Unione Europea.
In qualità di esperta nella gestione della ricerca (Research Manager), partecipa attivamente a tavoli istituzionali e dibattiti di rilievo nazionale — come gli incontri promossi dal Ministero dell'Università e della Ricerca (MUR) — focalizzati sulla sostenibilità a lungo termine delle infrastrutture scientifiche nel periodo post-PNRR.